Andreia J. Amaral é Professora Auxiliar de Melhoramento Animal e Genómica no Departamento de Zootecnia da Universidade de Évora. É também investigadora integrada do MED – Instituto Mediterrâneo para a Agricultura, Ambiente e Desenvolvimento (grupo Animal Biosciences, CHANGE). É licenciada em Engenharia Agronómica – Produção Animal (ISA, Universidade de Lisboa, 2000), mestre em Biologia da Conservação (Universidade de Lisboa, 2006) e doutorada em Ciência Animal pela Universidade de Wageningen (2010). O trabalho de doutoramento sobre os genomas do porco e da galinha contribuiu para o painel de genotipagem PorcineSNP60. Antes de chegar a Évora em 2022, foi investigadora de pós-doutoramento no Instituto de Medicina Molecular e no BioISI (2011–2017), na área dos pequenos RNAs e da imunologia humana. Foi depois investigadora auxiliar na Faculdade de Medicina Veterinária da Universidade de Lisboa (2017–2022).

A sua investigação usa a genómica e a bioinformática para compreender a adaptação, a resiliência e a resistência a doenças em animais criados em sistemas extensivos mediterrânicos e na África subsariana. Os seus temas principais são:

• a sequenciação do genoma completo e as assinaturas de seleção;
• a adaptação hospedeiro–agente patogénico (tripanossomose, coccidiose em ovinos Merino);
• a epigenética e a regulação génica (prolificidade em porcas de raça Alentejana);
• a resistência antimicrobiana numa perspetiva One Health.

É autora de mais de 30 artigos científicos com revisão por pares, publicados em revistas como The EMBO Journal, Genome Biology, Genetics Selection Evolution e Eurosurveillance. Coordena projetos financiados com financiamento nacional como o ResisTrypSheep e o OptigenPig, e participou nos consórcios H2020 BovReg e GEroNIMO. Tem representado Portugal em várias acções COST.

Colabora de perto com associações de criadores de raças autóctones portuguesas. Apoia-as na introdução de ferramentas genómicas nos programas de melhoramento, com avaliação da diversidade genética, correção de genealogias com painéis de SNP, avaliação genética com modelo de pai e desenho de painéis de controlo de filiação.  Forma técnicos das associações em cursos como "R for Population Genetics and Animal Breeding" (Erasmus+, 2024).

Leciona genética e melhoramento animal nos cursos de Medicina Veterinária e Zootecnia, orienta estudantes de doutoramento e mestrado e avalia propostas de investigação para agências de financiamento europeias. Desenvolveu a ferramenta de código aberto IsomiR_Window e contribui para a comunidade nf-core.